| 车次 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 |
| D4824 | 南京南 | 01:06 | 上海虹桥 | 02:25 |
| D7 | 南京 | 04:58 | 上海 | 07:25 |
| D9 | 南京 | 05:13 | 上海南 | 08:00 |
| D2281 | 南京南 | 06:32 | 上海虹桥 | 08:36 |
| D121 | 南京 | 09:33 | 上海 | 12:30 |
| D124 | 南京 | 09:33 | 上海 | 12:30 |
| D3013 | 南京南 | 11:00 | 上海虹桥 | 13:16 |
| D3016 | 南京南 | 11:00 | 上海虹桥 | 13:16 |
| D3141 | 南京南 | 11:12 | 上海虹桥 | 13:11 |
| D3144 | 南京南 | 11:12 | 上海虹桥 | 13:11 |
| D3009 | 南京南 | 11:45 | 上海虹桥 | 13:55 |
| D3012 | 南京南 | 11:45 | 上海虹桥 | 13:55 |
| D3045 | 南京南 | 12:46 | 上海虹桥 | 15:15 |
| D3048 | 南京南 | 12:46 | 上海虹桥 | 15:15 |
| D3005 | 南京南 | 15:26 | 上海虹桥 | 17:28 |
| D3008 | 南京南 | 15:26 | 上海虹桥 | 17:28 |
| D4017 | 南京南 | 15:53 | 上海虹桥 | 17:59 |
| D9511 | 南京 | 16:30 | 上海 | 20:03 |
| D9514 | 南京 | 16:30 | 上海 | 20:03 |
| D955 | 南京南 | 16:31 | 上海 | 18:25 |
| D958 | 南京南 | 16:31 | 上海 | 18:25 |
| D2211 | 南京南 | 16:57 | 上海虹桥 | 19:19 |
| D2211 | 南京南 | 16:57 | 上海南 | 19:49 |
| D2214 | 南京南 | 16:57 | 上海虹桥 | 19:19 |
| D2214 | 南京南 | 16:57 | 上海南 | 19:49 |
| D4941 | 南京南 | 18:00 | 上海虹桥 | 19:45 |
| D951 | 南京南 | 18:34 | 上海 | 20:21 |
| D954 | 南京南 | 18:34 | 上海 | 20:21 |
| D3055 | 南京南 | 18:57 | 上海 | 21:19 |
| D3058 | 南京南 | 18:57 | 上海 | 21:19 |
| D3021 | 南京南 | 19:19 | 上海虹桥 | 21:24 |
| D3024 | 南京南 | 19:19 | 上海虹桥 | 21:24 |
| D2215 | 南京南 | 19:24 | 上海虹桥 | 21:36 |
| D2215 | 南京南 | 19:24 | 上海南 | 22:14 |
| D2218 | 南京南 | 19:24 | 上海虹桥 | 21:36 |
| D2218 | 南京南 | 19:24 | 上海南 | 22:14 |
| D3059 | 南京南 | 19:30 | 上海虹桥 | 22:09 |
| D3062 | 南京南 | 19:30 | 上海虹桥 | 22:09 |
| D3089 | 南京南 | 19:49 | 上海虹桥 | 21:52 |
| D3092 | 南京南 | 19:49 | 上海虹桥 | 21:52 |
| D635 | 南京南 | 19:56 | 上海虹桥 | 22:15 |
| D638 | 南京南 | 19:56 | 上海虹桥 | 22:15 |
| D351 | 南京南 | 20:01 | 上海虹桥 | 22:21 |
| D354 | 南京南 | 20:01 | 上海虹桥 | 22:21 |
| D4828 | 南京南 | 23:13 | 上海虹桥 | 00:32 |
| D4436 | 南京南 | 23:21 | 上海虹桥 | 00:40 |